FS? Mix Direct for Tissue
Cat. #:P2071b,P2072b
產品簡介
FS??Mix Direct for Tissue是(shi)適合(he)組織樣本(ben)擴(kuo)增的(de)(de)(de)(de)(de)2×濃縮(suo)快(kuai)速(su)高(gao)效(xiao)PCR預混合(he)溶(rong)液(ye)(ye),含有FS? Taq DNA聚合(he)酶、dNTP混合(he)物、緩沖液(ye)(ye)等PCR擴(kuo)增必(bi)需組分(模(mo)板與引物除外)。使用(yong)時,僅(jin)需在擴(kuo)增體(ti)系(xi)中(zhong)加(jia)入簡單處理后(hou)的(de)(de)(de)(de)(de)樣本(ben)處理液(ye)(ye)和(he)引物即可(ke)進行(xing)PCR,從而可(ke)以極大(da)地簡化(hua)(hua)操(cao)作過程,縮(suo)短操(cao)作時間,降低污染(加(jia)樣次(ci)數減(jian)少)。FS??Mix Direct for Tissue的(de)(de)(de)(de)(de)反應體(ti)系(xi)經(jing)過優化(hua)(hua)處理,高(gao)靈(ling)敏(min)度(du)的(de)(de)(de)(de)(de)FS??Taq DNA聚合(he)酶確保處理液(ye)(ye)中(zhong)的(de)(de)(de)(de)(de)微量(liang)樣本(ben)得到高(gao)效(xiao)擴(kuo)增。本(ben)產品不用(yong)進行(xing)繁瑣的(de)(de)(de)(de)(de)DNA提(ti)取,最(zui)大(da)限度(du)減(jian)少實驗誤差和(he)交(jiao)叉污染;同時依靠特(te)殊的(de)(de)(de)(de)(de)緩沖體(ti)系(xi)增強(qiang)PCR擴(kuo)增的(de)(de)(de)(de)(de)特(te)異性,保證擴(kuo)增效(xiao)果與DNA模(mo)板擴(kuo)增效(xiao)果同樣可(ke)靠。
FS??Taq DNA聚合酶是根據蛋白工程原理,以Taq DNA聚合酶為基礎,研發設計的新一代DNA聚合酶。本產品具有類似KOD酶的快速擴增能力,延伸速度為20s/kb(70~75℃,簡單模板可達5s/kb)。是普通Taq DNA聚合酶的3倍,可縮短一半以上的擴增時間;同時具備Taq DNA聚合酶擴增效率高、適應性廣等優點。FS??Taq DNA聚合酶使用方法與普通Taq DNA聚合酶基本相同,只需注意適當縮短延伸時間。該酶具有5'→3'聚合酶活性,無3'→5'外切酶活性。擴增產物具有3'-dA突出端,可直接用于TA克隆。
產品組成
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Component |
P2071b |
P2072b |
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2× FS??Mix ? Direct for Tissue |
1 ml |
1 ml× 5 |
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超純水 |
1 ml |
1 ml× 5 |
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Neutralization? ? Solution?? |
1 ml |
5 ml |
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Extraction? ? Solution???? |
10 ? ml |
40 ? ml |
本產(chan)品分體系(xi)中包(bao)(bao)(bao)含(han)溴(xiu)酚藍(lan)、不含(han)溴(xiu)酚藍(lan)兩(liang)類(lei)。體系(xi)中包(bao)(bao)(bao)含(han)溴(xiu)酚藍(lan)的產(chan)品,PCR擴(kuo)(kuo)增產(chan)物可直接電泳檢測。這兩(liang)類(lei)產(chan)品的擴(kuo)(kuo)增性能無(wu)差異。如無(wu)特(te)別(bie)說明提(ti)供體系(xi)中包(bao)(bao)(bao)含(han)溴(xiu)酚藍(lan)的包(bao)(bao)(bao)裝。
保存條件
-20℃保存2年。
質量控制
純(chun)度檢測:經(jing)質量(liang)檢測,產(chan)品不含脫(tuo)氧(yang)核糖核酸內切酶(mei)、脫(tuo)氧(yang)核糖核酸外切酶(mei)和(he)核糖核酸酶(mei)污染。
功能(neng)檢測(ce):PCR方法檢測(ce)無宿(su)主殘余DNA,能(neng)有效擴增人(ren)基因(yin)組中(zhong)的單拷貝基因(yin)。
應用舉例
1.?處理樣品
組織:取3-5mg組(zu)織置于1.5ml離(li)心管中,加(jia)入(ru)180 μl Extraction?Solution,充分渦(wo)旋振蕩,95℃溫浴10min。加(jia)入(ru)20 μl?Neutralization?Solution,充分渦(wo)旋振蕩,5,000rpm離(li)心2min,取0.5-2 μl上清進行擴增。
頭發:取(qu)兩根帶(dai)毛(mao)(mao)囊(nang)的頭(tou)發(fa),剪下(xia)帶(dai)毛(mao)(mao)囊(nang)的發(fa)根放(fang)入(ru)1.5ml離心(xin)管(guan)中,加入(ru)180 μl Extraction?Solution,充(chong)分渦(wo)旋振蕩,95℃溫浴10min。加入(ru)20 μl?Neutralization?Solution,充(chong)分渦(wo)旋振蕩,5000rpm離心(xin)2min,取(qu)0.5-2 μl上清進行擴(kuo)增。
口腔拭子:取樣前30min內請勿進(jin)(jin)食(shi)及飲(yin)水,使用(yong)無菌棉(mian)簽在(zai)口腔內擦拭10次。將棉(mian)球剪下置于1.5ml離(li)心管中,加入(ru)180 μl Extraction? Solution,充分渦(wo)(wo)旋振蕩,95℃溫浴10min。加入(ru)20 μl?Neutralization?Solution,充分渦(wo)(wo)旋振蕩,5,000rpm離(li)心2min,取0.5-2 μl上清進(jin)(jin)行擴增。
培養細胞:如果是懸浮培養細胞直接取1×103-104當量的細胞加入(ru)到50 μl?PCR反應體系(xi)中即可。如果是貼(tie)壁培養細胞,取(qu)3-5mg細胞組織置于1.5ml離心管中,加入(ru)180 μl Extraction?Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入(ru)20 μl?Neutralization?Solution,充分渦旋振蕩,5,000rpm離心2min,取(qu)0.5-2 μl上(shang)清進行擴增(zeng)。
血液、淋巴液DNA病毒:取(qu)(qu)100 μl血清(qing)或淋巴(ba)液至1.5ml離心管(guan)中,加入180 μl Extraction?Solution,充分渦旋(xuan)振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl?Neutralization? Solution,充分渦旋(xuan)振蕩,12,000rpm離心10min,取(qu)(qu)0.5-2 μl上清(qing)進行擴增。
2.?配制反應體系
請于冰上配置反應體系,體系大小與組分用量與添加順序可調整:
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Ordinal |
Component |
Volume (50 μl reaction volume) |
Final ? concentration (50 μl reaction volume) |
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1 |
2× FS??Mix ? Direct for Tissue |
25 ? μl |
1× |
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2 |
upstream ? primer (10 μM)[1] |
2 μl |
0.4 ? μM |
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3 |
downstream ? primer (10 μM)[1] |
2 μl |
0.4 ? μM |
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4 |
處理液上清 |
0.5-2 ? μl |
<1μg |
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5 |
超純水[2] |
To 50 ? μl |
- |
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optional |
MgCl2(MgSO4)/PCR ? Enhancer[3] |
Variable |
- |
[1]?引(yin)物終濃(nong)度(du)建議范圍:0.1-1 μM。特異性差時(shi)可降(jiang)低濃(nong)度(du),效率低時(shi)可提高濃(nong)度(du)。
[2]?可單獨訂(ding)購超純水(Cat. #:P9021/P9022/P9023)。
[3]?可單獨訂購25mM MgCl2(Cat. #:P9031)和PCR Enhancer(Cat. #:P9041)。
3.?設定反應程序進行PCR反應
大多數模(mo)板(ban)的(de)快(kuai)速擴增條(tiao)件:
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Stage ? |
Temperature |
Time |
Number ? of Cycles |
|
Initial ? Denaturation |
94℃ |
3 ? min |
1 |
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Denaturation |
94℃ |
30 ? sec |
28-40 ? |
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Annealing |
55-68℃[1] |
30 ? sec |
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|
Extension |
72℃ |
Variable[2] |
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Final ? Extension |
72℃ |
2 ? min |
1 |
[1]?退火溫(wen)度應根據Tm值(zhi)較(jiao)低的引物來(lai)設。
[2]?延伸時(shi)間按20 sec/kb來設(she)最佳。
1kb簡單模板的(de)快速(su)擴增條件:
由于1kb簡單(dan)模板的二級(ji)結構簡單(dan),且長度較(jiao)短(duan),可同時縮短(duan)變(bian)性、退火時間(jian)至15s,延(yan)伸時間(jian)20s,以實現快速擴(kuo)增。
4.?分析結果
反應產物可直接進行瓊脂糖凝膠電泳,通過凝膠成像設備觀察目的條帶的擴增情況。如有需要,可進行割膠回收。無產物或產物量少的改進措施有:1調整退火溫度;2減少抑制劑的影響,如提取的基因組DNA中含有抑制擴增的成分,需要高倍稀釋(1: 10000)后使用;3采用乙醇沉降洗脫,提高模板DNA的純度;4使用PCR添加劑,如PCR Enhancer(Cat. #:P9041)、MgCl2(Cat. #:P9031)等可提(ti)高產量。
操作注意事項
處理的組織樣本往往不會完全溶(rong)解,這是正(zheng)常現象。溶(rong)解在處理液中(zhong)的組織樣本足(zu)夠(gou)滿足(zu)FS??Mix Direct for Tissue擴(kuo)增的需要。
室溫下FS??Taq DNA聚合酶有(you)一定(ding)的活性,為(wei)避免發(fa)生非特異性擴(kuo)增,請于冰上配置反應(ying)體系(xi),并且最后添加模(mo)板DNA。
延(yan)(yan)伸(shen)時間視(shi)片(pian)段(duan)長度(du)而定。一般情況,≤500bp目的片(pian)段(duan)延(yan)(yan)伸(shen)15s,500bp-1kb延(yan)(yan)伸(shen)20s,>1kb延(yan)(yan)伸(shen)時間按20s/kb計(ji)算。
FS? Taq DNA聚合酶(mei)具(ju)有脫氧(yang)核(he)苷(gan)酸(suan)轉移酶(mei)活性,因此在PCR產物3’末端(duan)通常會加上一個多余的(de)脫氧(yang)腺嘌呤核(he)苷(gan),可(ke)進行(xing)TA克(ke)隆(long)。
FS??Mix Direct for Tissue也可采(cai)用常(chang)規程序擴(kuo)增(zeng)。
引物設計注意事項
引(yin)(yin)物(wu)長度一般在(zai)(zai)15-30個(ge)堿基之間(jian)(jian);上下游(you)(you)引(yin)(yin)物(wu)3’末端避免互補,避免出現3個(ge)以上重復(fu)的(de)G或C,或出現發夾結構,否則會產生非(fei)(fei)特異性擴增;GC含量(liang)控制在(zai)(zai)40-60%,且(qie)上下游(you)(you)引(yin)(yin)物(wu)GC含量(liang)盡(jin)量(liang)接(jie)近(jin);Tm值控制在(zai)(zai)55-65℃之間(jian)(jian),且(qie)上下游(you)(you)引(yin)(yin)物(wu)Tm值盡(jin)量(liang)接(jie)近(jin),額外附加序列(lie)(酶(mei)切位點、修飾等(deng))是(shi)非(fei)(fei)模板(ban)匹配(pei)序列(lie),不參與Tm值計(ji)算。
相關產品
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名稱 |
貨號 |
規格 |
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PCR Mix |
P2011/P2012/P2013/P2014/P2015 |
1ml/5ml/10ml/50ml/100ml |
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Power Green qPCR Mix |
P2101/P2102/P2103/P2104/P2105 |
1ml/5ml/10ml/50ml/100ml |
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1kb ladder |
M1181/M1182 |
50次/250次 |
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DSTM5000 |
M1111/M1112 |
60次/300次 |
|
高純(chun)度質粒小提(ti)試劑盒 |
N1011/N1012/N1013 |
50次/100次/200次 |
|
通用RNA提取試(shi)劑盒 |
R1051 |
50次 |
|
基(ji)因組(zu)DNA快速提取試劑(ji)盒(he) |
N1111/N1112 |
50次/100次 |
|
DNA凝膠回收試劑盒 |
N1071/N1072/N1073 |
50次/100次/200次 |
|
RT-PCR Kit |
R1011/R1012 |
20次/100次 |
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